20 сентября 2015 г.

АЧС в Беларуси и биномиальное распределение

Пролог
Конечно, Департамент ветеринарного и продовольственного надзора предпринимает меры контроля и ограничений по поставкам кормового сырья и готовой животноводческой продукции из неблагополучных по заболеванию регионов. Но эти действия должны быть основаны на точном знании обстановки и уверенности в том, что ветеринарные службы сопредельных стран работают в понятном нам режиме. К сожалению, в Польше и Литве работа ведется в немыслимо скромных масштабах, в том числе по регионализации и проведению комплекса мер по ликвидации заболевания. ... Национальные ветеринарные службы и инспекторская ветеринарная служба ЕС не предпринимают серьезных мер по организации оздоровительных мероприятий. ... В нашей республике к АЧС отношение ответственное. Принято Постановление Совета Министров Республики Беларусь от 29 августа 2013г. №758... Ветеринарная служба Республики Беларусь ‒ одна из самых подготовленных в мире, как в кадровом, так и в организационно-правовом отношении, так как знает ситуацию изнутри, а не только по регламентирующим документам.
главный государственный ветеринарный инспектор Республики Беларусь
22 апреля 2014 г.

Вводная часть
Африканская чума свиней (АЧС) - основная причина отсутствия свиноводства в Африке. Международное эпизоотическое бюро (МЭБ) собирает и публикует официальные данные по распространению этой болезни в мире. ФАО на своём сайте начала выкладывать эти сообщения на карте. Эти карты мы и рассмотрим.
Для начала приведу карту всех случаев за последние 5 лет (картинки можно увеличить по щелчку мыши). Видно, что они затрагивают только Африку и Евразию.


Большинство случаев было зарегистрировано в Европе.

Начало эпидемии в Европе было положено в 2013 году. График показывает, что о снижении числа зарегистрированных случаев пока говорить рано. Сформировалась сезонность, с преобладанием пиков в конце лета и зимой.

Карта распространения АЧС не совпадает с картой плотности свиноводства в Европе, что говорит о том, что многие крупные центры свиноводства не задеты.

Из всех случаев - 2 были отмечены в Беларуси. Оба случая произошли летом 2013 года у домашних свиней. Большинство же случаев в соседних странах - это АЧС у диких кабанов.

С тех пор ни одного случая в Беларуси не произошло (1.09.2013-1.09.2015).

Вот так выглядят увеличенные фрагменты границы Беларуси и Польши. на этих фрагментах не указаны названия стран. Найти Беларусь вам поможет тот факт, что в Беларуси за последние 2 года случаев АЧС не было.

Беларуси и Литвы.

Беларуси и Латвии.

Беларуси и России.

Беларуси и Украины.

Теория вероятности и вера в биноминальное распределение
Теперь немного про биноминальное распределение. Сейчас я 10 раз подкинул монету из них 6 раз у меня выпал "орёл".

По-моему подбрасывание было честным, так как "орёл" выпал в ~50% случаев. Если вы сейчас начнете подбрасывать монету 10 раз, какая вероятность, что вы повторите мой результат? Эта простая задача, если использовать формулу биноминального распределения:
;
где P(k) - вероятность k успехов из n попыток,
p - вероятность успеха при одной попытке (n = k = 1). При моем подбрасывание монеты p = 50% = 0.5.

Можно воспользоваться одним онлайн-калькулятором (10!/(6!*(10-6)!)0.5^6(1-0.5)^(10-6)) или другим (0.5, 10, 6), ответ в любом случае будет 20,5%.

Вероятность того, что у вас (или меня) выпадет 1 "орёл" из 10 бросков - 0,98%. 0 "орлов" - 0,10%. А вероятность того, что выпадет 4-6 "орлов" (P(4)+P(5)+P(6)) - 65.63%. 

А теперь вооруженные формулой вернемся к АЧС. Допустим, что больные дикие кабаны умирают на границе с одной стороны с 50% вероятностью (p=0.5). Мы имеем не менее 10 случаев на каждой из 5 границ (n=10x5=50). Вероятность получить менее 1 случая (k=0) для одной из этих территорий по нашему усмотрению будет равна 0.0000000000001%. Это чуть вероятнее, чем ваш шанс выиграть в честную лотерею с одним выигрышным билетом, при том, что вам выдан один билет, а у каждого жителя нашей планеты имеется 157 200 подобных билетов.

Если же допустить, что у дикого кабана есть предпочтения умирать не на территории Беларуси, а в Польше (n=71) и именно так и происходит в 90% случаев (p=0.9), то вероятность нынешней ситуации (P(0)) только на этом участке границы равна 0,06%. Легко подсчитать вероятность иметь больше 0 случаев (k≥1) на этой границе (1-P(0)) - 99.9436%. Для всех вместе взятых границ ситуация должна быть хуже текущей в 99.99999999999991% подобных случаев.

Получается, что наблюдаемая ситуация чрезвычайно уникальная.

Весточки "из-за бугра"
Seventy-five per cent of the notifications [in Poland and Baltic countries] were located less than 13 km from the border with Belarus and the Russian Federation, confirming the hypothesis of transboundary spread of ASFV via connected wild boar sub-populations.
The European Food Safety Authority (EFSA)

Although there are not recent official reports of new cases in Belarus, there is indication that the ASF epidemic is still on-going there, possibly in domestic pigs and wild boar.
The European Food Safety Authority (EFSA)

Furthermore, there is concern that ASFV may have been spilled over in the wild boar population in the areas bordering Smolensk oblast and possibly in other parts of Belarus. Based on the official information, there have been only a few outbreaks in Ukraine and Belarus. However, considering unofficial information, these may not have been the first cases. The reported outbreaks have all been controlled rapidly.
The European Food Safety Authority (EFSA)

There are only a limited number of ongoing activities that will facilitate early detection of secondary spread in Ukraine and Belarus.
The European Food Safety Authority (EFSA)

The currently applied wild boar depopulation regime in Belarus, may increase the risk of spread of ASFV.
The European Food Safety Authority (EFSA)

Unfortunately Belarus does not reveal the situation within its area which is a critical problem in the elimination of this virus.
Dr John Carr

Belarusian authorities have denied the ASF outbreak and justify the sacrifice and burning of the animals as part of a simulation exercise conducted in the regions of Novogrudok and Korelichy. However, this simulation is not recorded on the website of the OIE (OIE, 2012) and would be the first time that the realization of a simulation implies the sacrifice and burning of animals involved on it.
http://www.sanidadanimal.info/sanidadanimal/en/actividades/emerging-online/african-swine-fever-asf/134-nuevas-comunicaciones-peste-porcina-africana.html

The most likely scenario appears to be the passage of wild boars from Belarus where the situation of ASFV has been described by the European Commission as “out of control”.
http://www.face.eu/about-us/resources/news/african-swine-fever-shooting-shooting-shooting-is-not-the-solution

There have been no reports of outbreaks in Belarus since 2013, but infected meat originating from the country continues to be seized in other nations
The high number of cases around Belarus's border has also increased concerns of misreporting.
The APHA [a Defra agency] update said: "Poland and the Baltic states have stepped up border controls and have seized meat products entering the EU in transport and luggage and which consequently tested positive for ASF.

6 meat product samples (out of 42 tested), taken out on the BIP Silene (on the border with Belarus ) were found PCR positive on ASF virus genome. All 6 products were produced by Belarus commercial meat producers and wrapped in a commercial packaging.

In November [in Lithiuania] out of 3 samples from confiscated meat products [in personal luggage in the border crossing posts] 1 was found positive to ASF. In December 1 sample was found positive to ASF.

«Последние два очага африканской чумы свиней зафиксированы в минувшие дни в Суражском районе Брянской области. В одном случае на павшем поросенке была обнаружена маркировка, характерная для белорусских хозяйств, в другом люди купили молодого поросенка с рук у торговцев на автомобиле с белорусскими номерами», — пояснили в пресс-службе ветеринарного ведомства [Россельхознадзор], подчеркнув, что все павшие животные покупались вне официальных рынков.
Россельхознадзор обвинил Беларусь в распространении АЧС на Брянщине

Update (5/2/2016):
In these countries [Russia and Belarus], the disease is not being effectively controlled and continued spill-over into bordering regions is likely to occur as a result.
Gallardo et al. Porcine Health Management (2015) 1:21
DOI 10.1186/s40813-015-0013-y

Комментариев нет:

Отправить комментарий

Подписаться на: Комментарии к сообщению (Atom)